Im Großen und Ganzen übernehmen Gesundheitsmanager betriebswirtschaftliche Aufgaben wie Controlling, Finanzverwaltung, Einkauf und Personalführung in sämtlichen Einrichtungen des Gesundheitswesens. Dazu gehören beispielsweise Krankenhäuser, Versorgungszentren oder Kranken- und Rentenversicherungen. Je nachdem, wo genau sie arbeiten, kommen sie aber auch stark mit anderen Disziplinen, z.B. dem Medizinrecht, Psychologie oder Soziologie in Berührung. Zum Beruf Gesundheitsmanager gehört mitunter aber auch, Maßnahmen zur Suchtprävention zu konzipieren und zu betreuen oder zwischen Patienten, Krankenkassen, Ärzten und Medikamentenherstellern zu vermitteln.

Deine Arbeit kann populations- oder gemeindebezogen ausfallen und sich um eine bevölkerungsweiten Versorgung drehen. Arbeitest du dagegen anbieterorientiert, bist du z.B. in die Bedarfsplanung und Sicherstellung der Versorgung z.B. durch Krankenhäuser involviert. Bei einer Patienten- und Konsumentenorientierung stehen die gesundheitsspezifischen Patientenbedürfnisse im Mittelpunkt deiner Arbeit, bei der Systemorientierung hingegen mehr die Finanzierung und das Controlling im industriegesellschaftlichen Gesundheitswesen.

Ein populäres Einsatzgebiet für Gesundheitsmanager ist außerdem das betriebliche Gesundheitsmanagement. Hier gestaltest, lenkst und entwickelst du Maßnahmen, um die Arbeit, Organisation und das Verhalten am Arbeitsplatz gesundheitsförderlich zu gestalten. Du schätzt die psychischen und physischen Belastungen ein, entwickelst Maßnahmen wie etwa einer gesünderen Kantinenverpflegung,  führst Mitarbeiterbefragungen durch und vermittelst als Konfliktlöser zwischen mehreren Mitarbeitern und Abteilungen. Auch der Ausbau der innerbetrieblichen Freizeit- und Sportmöglichkeiten und des Betreuungsangebot für Angestelltenkinder gehört hier zum Beruf des Gesundheitsmanagers.

Bei deiner täglichen Arbeit wertest du Studien und Statistiken aus und entwickelst, überwachst und evaluierst deine Maßnahmen. Außerdem stehst du in häufigem Dialog mit Kunden oder externen Partnern wie Krankenkassen und Fitnessstudios. Oft arbeitest du auch eng mit Ärzten und Sozialwissenschaftlern zusammen, um vor allem über die Situation im öffentlichen Gesundheitswesen zu untersuchen. Mitunter gehört auch Kundenakquise zu deinem Job, etwa wenn du ein Unternehmen überzeugen musst, dir die Einführung eines betrieblichen Gesundheitsmanagements zu übertragen. Gerade im Rahmen dieser Kommunikation musst du deinen Schreibtisch dabei öfters mal verlassen und besuchst Unternehmen und andere Einrichtungen, besuchst Messen und hältst Vorträge an Schulen oder auf Tagungen.